UCS baut auf Debian-identischen Sourcen auf. Verwendet wird ein Kernel mit den gleichen Quellen wie bei der Debian-Distribution und mit nahezu identischer Konfiguration. Deshalb werden die meisten von Debian unterstützten Hardware-Systeme ebenfalls von UCS unterstützt.

Univention Corporate Server unterstützt drei Kernel-Varianten; neben dem Standard-Kernel in UCS 2.x, dem über den gesamten Produktzyklus gepflegten 2.6.18 Kernel, gibt es Ergänzungskernel, die Unterstützung für aktuellere Hardware bereitstellen. Die aktuellen Ergänzungskernel basieren auf 2.6.26 und 2.6.30 und bieten u.a. verbesserten Treiber-Support.

Kernel-Funktion	Linux 2.6.18	Linux 2.6.26	Linux 2.6.30
Standard-Kernel-Treiber	ja	ja	ja
Xen Dom0-Betrieb	ja	ja	nein
Fritz PCI ISDN-Treiber	ja	nein	ja
FSC Serverview-Monitoring-Module	ja	ja1	ja1
DRBD-Module	ja	ja	ja
Squashfs-Module	ja	ja	ja2
1 Die Treiber für 2.6.26 und 2.6.30 sind nicht offiziell von FSC unterstützt.
2 Diese Module sind direkt in den Thin Client-Kernel integriert.